Вы меняете один байт в файле, который лежит в образе контейнера, и эта операция вдруг занимает секунды, а не микросекунды. Второй раз — снова мгновенно. Дело не в диске и не в приложении: overlayfs при первом изменении файла из read-only слоя обязана скопировать его целиком в записываемый слой, прежде чем применить вашу правку. Дальше файл уже «наверху», и все следующие обращения к нему идут по обычной, быстрой дорожке.
Подробнее →